Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM2Q00987 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms