Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMP3P35625 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMP3P35625 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms