Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFHP08603 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFHP08603 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFHP08603 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHP08603 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHP08603 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHP08603 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHP08603 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHP08603 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHP08603 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFHP08603 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHP08603 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHP08603 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHP08603 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHP08603 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHP08603 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHP08603 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFHP08603 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFHP08603 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CFHP08603 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHP08603 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHP08603 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHP08603 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHP08603 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHP08603 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHP08603 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHP08603 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHP08603 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFHP08603 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFHP08603 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFHP08603 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFHP08603 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFHP08603 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHP08603 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHP08603 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHP08603 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHP08603 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHP08603 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHP08603 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHP08603 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFHP08603 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHP08603 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHP08603 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHP08603 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHP08603 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHP08603 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHP08603 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHP08603 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms