Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBB3O95704 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBB3O95704 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBB3O95704 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APBB3O95704 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBB3O95704 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBB3O95704 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBB3O95704 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBB3O95704 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBB3O95704 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBB3O95704 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBB3O95704 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBB3O95704 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBB3O95704 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.7 ms