Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PSME2-210ENST00000559493 702 ntTSL 25.88□□□□□ -1.475e-8■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 TERF1-206ENST00000518961 3300 ntTSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.517e-16■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 TMEM260-210ENST00000556422 3864 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.595e-6■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.835e-8■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 PMS1-216ENST00000447734 570 ntTSL 53.57□□□□□ -1.845e-8■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 PMS1-209ENST00000424059 2004 ntTSL 1 (best)2.62□□□□□ -1.995e-8■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 CACUL1-202ENST00000477583 432 ntTSL 1 (best)1.75□□□□□ -2.137e-16■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 PMS1-210ENST00000424307 2153 ntTSL 50.9□□□□□ -2.265e-8■■■■■ 189.5
SF3B1O75533 NDRG1-225ENST00000522890 581 ntTSL 517.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 417.27■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 416.66■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 414.8□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 414.31□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 WNT5B-205ENST00000539198 530 ntTSL 423.84■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 WNT5B-210ENST00000545811 661 ntTSL 221.44■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-210ENST00000514171 880 ntTSL 319.07■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-208ENST00000512542 307 ntTSL 314.85□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-207ENST00000512373 545 ntTSL 412.39□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-206ENST00000510502 571 ntTSL 210.94□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 ANXA3-205ENST00000508214 567 ntTSL 33.77□□□□□ -1.816e-7■■■■■ 188.5
SF3B1O75533 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 188.4
SF3B1O75533 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 421.78■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 188.2
SF3B1O75533 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 321.78■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 188.2
SF3B1O75533 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 419.8■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 188.2
SF3B1O75533 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 188.2
SF3B1O75533 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 314.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 188.2
SF3B1O75533 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 188.2
SF3B1O75533 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 187.9
SF3B1O75533 SAFB-207ENST00000589863 2708 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 187.9
SF3B1O75533 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 187.9
SF3B1O75533 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 187.9
SF3B1O75533 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 187.9
SF3B1O75533 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 187.9
SF3B1O75533 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.376e-10■■■■■ 187.6
SF3B1O75533 DGAT1-207ENST00000531896 981 ntTSL 327.31■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 187.5
SF3B1O75533 DGAT1-204ENST00000525371 840 ntTSL 522.71■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 187.5
SF3B1O75533 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.032e-7■■■■■ 187.5
SF3B1O75533 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.152e-7■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.066e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 227.3■■□□□ 1.966e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.896e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-207ENST00000470417 1931 ntTSL 326.09■■□□□ 1.776e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FGGY-219ENST00000582567 563 ntTSL 425.91■■□□□ 1.746e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKD2-209ENST00000597589 1682 ntTSL 525.67■■□□□ 1.76e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-204ENST00000431732 767 ntTSL 524.96■■□□□ 1.596e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 IFNGR1-202ENST00000414770 748 ntTSL 324.92■■□□□ 1.586e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 224.92■■□□□ 1.586e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.576e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.56e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SVIL-AS1-205ENST00000430295 440 ntTSL 223.73■■□□□ 1.396e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 IFNGR1-204ENST00000478333 643 ntTSL 223.21■■□□□ 1.316e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 322.89■■□□□ 1.266e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.246e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-204ENST00000546671 873 ntTSL 322.36■■□□□ 1.176e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 XPO4-204ENST00000490513 914 ntTSL 422.18■■□□□ 1.146e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKD2-212ENST00000599019 1703 ntTSL 522.05■■□□□ 1.126e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-212ENST00000492383 989 ntTSL 221.77■■□□□ 1.076e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 521.54■■□□□ 1.046e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 DOCK6-205ENST00000586702 1249 ntTSL 221.21■□□□□ 0.996e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GALNT12-203ENST00000610463 550 ntTSL 420.83■□□□□ 0.936e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.896e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.856e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.846e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NT5DC2-209ENST00000478091 590 ntTSL 320.27■□□□□ 0.846e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NADSYN1-217ENST00000530534 844 ntTSL 219.93■□□□□ 0.786e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.756e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PACS2-206ENST00000547903 1157 ntTSL 519.43■□□□□ 0.76e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 UBXN6-207ENST00000591919 1613 ntTSL 519.43■□□□□ 0.76e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SLC19A1-208ENST00000468508 1435 ntTSL 219.34■□□□□ 0.696e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.636e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NT5DC2-206ENST00000466112 887 ntTSL 218.96■□□□□ 0.636e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.616e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.66e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-209ENST00000594740 857 ntTSL 218.79■□□□□ 0.66e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.566e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.556e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.546e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-206ENST00000449649 667 ntTSL 518.29■□□□□ 0.526e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PER1-208ENST00000579065 1262 ntTSL 518.15■□□□□ 0.56e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.476e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PACS2-212ENST00000551743 1876 ntTSL 517.96■□□□□ 0.466e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-202ENST00000412383 981 ntTSL 317.8■□□□□ 0.446e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-203ENST00000593785 1536 ntTSL 1 (best)17.77■□□□□ 0.446e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.426e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 IFNGR1-203ENST00000458076 753 ntTSL 317.53■□□□□ 0.46e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.396e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 TOM1-212ENST00000456128 1133 ntTSL 517.14■□□□□ 0.336e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.326e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.36e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-216ENST00000597274 583 ntTSL 216.82■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-208ENST00000529030 794 ntTSL 316.78■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-205ENST00000525229 588 ntTSL 316.78■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.256e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-211ENST00000533151 563 ntTSL 316.61■□□□□ 0.256e-10■■■■■ 187.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 292.8 ms