Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TIMM17BO60830 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM17BO60830 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TIMM17BO60830 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TIMM17BO60830 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM17BO60830 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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