Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PLXNC1O60486 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNC1O60486 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms