Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MATN3O15232 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN3O15232 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN3O15232 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN3O15232 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN3O15232 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN3O15232 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN3O15232 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN3O15232 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN3O15232 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN3O15232 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN3O15232 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN3O15232 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN3O15232 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN3O15232 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN3O15232 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN3O15232 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN3O15232 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN3O15232 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms