Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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