Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXLNAP40222 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms