Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TXLNAP40222 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TXLNAP40222 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TXLNAP40222 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TXLNAP40222 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TXLNAP40222 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TXLNAP40222 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TXLNAP40222 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TXLNAP40222 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TXLNAP40222 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TXLNAP40222 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TXLNAP40222 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TXLNAP40222 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TXLNAP40222 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXLNAP40222 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TXLNAP40222 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TXLNAP40222 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TXLNAP40222 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TXLNAP40222 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TXLNAP40222 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TXLNAP40222 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TXLNAP40222 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TXLNAP40222 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TXLNAP40222 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TXLNAP40222 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TXLNAP40222 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TXLNAP40222 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TXLNAP40222 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TXLNAP40222 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TXLNAP40222 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TXLNAP40222 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TXLNAP40222 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TXLNAP40222 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TXLNAP40222 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TXLNAP40222 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TXLNAP40222 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TXLNAP40222 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TXLNAP40222 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TXLNAP40222 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TXLNAP40222 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TXLNAP40222 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TXLNAP40222 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TXLNAP40222 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TXLNAP40222 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TXLNAP40222 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TXLNAP40222 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TXLNAP40222 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TXLNAP40222 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TXLNAP40222 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TXLNAP40222 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TXLNAP40222 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TXLNAP40222 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TXLNAP40222 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TXLNAP40222 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TXLNAP40222 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TXLNAP40222 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TXLNAP40222 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TXLNAP40222 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TXLNAP40222 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TXLNAP40222 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TXLNAP40222 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TXLNAP40222 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TXLNAP40222 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TXLNAP40222 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TXLNAP40222 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TXLNAP40222 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TXLNAP40222 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TXLNAP40222 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TXLNAP40222 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TXLNAP40222 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TXLNAP40222 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TXLNAP40222 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TXLNAP40222 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TXLNAP40222 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TXLNAP40222 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TXLNAP40222 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TXLNAP40222 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TXLNAP40222 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TXLNAP40222 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TXLNAP40222 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TXLNAP40222 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TXLNAP40222 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TXLNAP40222 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TXLNAP40222 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TXLNAP40222 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TXLNAP40222 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TXLNAP40222 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TXLNAP40222 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TXLNAP40222 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TXLNAP40222 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TXLNAP40222 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TXLNAP40222 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TXLNAP40222 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TXLNAP40222 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TXLNAP40222 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TXLNAP40222 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TXLNAP40222 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TXLNAP40222 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TXLNAP40222 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TXLNAP40222 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms