Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms