Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms