Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms