Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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ZNF56Q15929 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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ZNF56Q15929 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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ZNF56Q15929 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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ZNF56Q15929 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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ZNF56Q15929 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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ZNF56Q15929 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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ZNF56Q15929 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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ZNF56Q15929 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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ZNF56Q15929 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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ZNF56Q15929 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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