Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPRKQ15262 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPRKQ15262 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPRKQ15262 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPRKQ15262 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPRKQ15262 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPRKQ15262 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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PTPRKQ15262 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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