Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms