Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms