Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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