Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM175Q9BSA9 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms