Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms