Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms