Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO38Q6PIJ6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXO38Q6PIJ6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms