Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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MMP11P24347 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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MMP11P24347 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MMP11P24347 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MMP11P24347 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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