Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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