Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms