Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms