Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms