Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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