Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms