Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTBP2P56545 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms