Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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