Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TMEM27Q9HBJ8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TMEM27Q9HBJ8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TMEM27Q9HBJ8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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