Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS8Q99627 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms