Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2D1P51668 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms