Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms