Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARHGAP28Q9P2N2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms