Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL40Q2TBA0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms