Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GRK1Q15835 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms