Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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