Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms