Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPB2P35606 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPB2P35606 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms