Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms