Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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