Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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