Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms