Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms