Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms