Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms