Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TREX2Q9BQ50 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms